Die heutige Studienkirche und ehemalige Jesuiten- und Universitätskirche aus den Jahren 1610-17 ist der bedeutendster Dillinger Sakralbau. Erbaut wurde sie nach Entwürfen des kaiserlichen Kammermalers Joseph Heintz unter der Mitwirkung bedeutender Künstler, wie z.B. Johann Alberthal, Thomas Scheffler und Johann Michael Fischer. Der Kircheninnenraum wurde in den Jahren 1756-68 im Rokokostil umgestaltet. Der Hauptaltar ist einer der wenigen erhaltenen Bühnenaltäre Deutschlands. Er wurde um 1760 von Johann Anwander (1715–1770) geschaffen. Jedes Jahr in der Woche vor Palmsonntag öffnet sich hinter dem versenkten Altarblatt in sechs Metern Höhe ein Raum mit Kulissen und Figuren, die die Stationen des Leidensweges Christi von der Geißelung bis zur Auferstehung nachvollziehen.