Höchstädt verfügt über einen eigenen Bahnhof, an dem unter der Woche stündlich und am Wochenende zweistündlich Züge in Richtung Donauwörth/Ingolstadt bzw. Günzburg/Ulm verkehren. Der Bahnhof liegt 10 bis 15 Minuten von der Innenstadt entfernt. Vor dem Bahnhof sind ausreichend kostenfreie Parkplätze und Fahrradstellplätze vorhanden. Der Bahnhof wurde barrierefrei umgebaut.